Кандалакшский заповедник появился в 1932 году, однако до 1951 года он имел статус заказника и заповедником является только с 1951 года. Его создание связано с необходимостью охраны обыкновенной гаги. Обыкновенная гага – крупная северная морская утка, известная своим ценным пухом. 

В задачи Кандалакшского заповедника входит не только охрана и изучение биогеоценозов Кандалакшского залива и Мурмана, но и мониторинг антропогенного воздействия, а также разработка методов сохранения и восстановления экосистем. 

Территория Кандалакшского заповедника частично включает в себя Кандалакшский, Терский, Североморский, Печенгский районы Мурманской области, а также Лоухский район Карелии. Примерно 70% площади заповедника является морской акваторией (Порья губа, воды северного лесничества, залив Бабье море у острова Великого и в районе Роговых луд).

Остальная территория заповедника представляет собой поверхность островов и приморскую местность. Там преобладает равнинный рельеф, лишь отдельные горные вершины достигают высоты восемьдесят метров над уровнем моря. 

Разнообразие животного и растительного мира Кандалакшского заповедника обусловлено разобщённостью его участков. НАЗЕМНАЯ ФАУНА ЗАПОВЕДНИКА ПРЕДСТАВЛЕНА 21 ВИДОМ МЛЕКОПИТАЮЩИХ, 134 видами птиц, 2 видами рептилий и 3 видами амфибий. Ещё множество млекопитающих и птиц находятся на территории заповедника непостоянно. 

Наиболее полно фауна Кандалакшского заповедника представлена на острове Великом и соседнем Ковдском полуострове. Их общая площадь составляет около десяти тысячь гиктаров. Однако эта территория недостаточна для охотничьих участков крупных наземных хищников (рысь, волк, росомаха). Они бывают там нерегулярно. 

Постоянно на территории Кандалакшского заповедника можно встретить лося, бурого медведя, лисицу, зайца-беляка, лесную куницу, белку, горностая. Среди птиц заповедника особое место занимают обыкновенная гага, длинноносый крохаль, обыкновенный турпан. Встречается кречет – разновидность сокола с размахом крыльев до 1,35 метра, и многие другие крылатые представители фауны. 

Флора заповедника в своём многообразии не уступает фауне. Список растений Кандалакшского заповедника составляет 633 вида, не считая мхов. Примерно 80% земель покрывают северотаёжные леса.

Сосна встречается чаще, чем ель. Очень распространены смешанные леса с участием мелколиственных пород (берёза, реже осина). В заповеднике представлен замечательный пример способности сосны произрастать даже в условиях, совершенно непригодных для иной древесной растительности – сосняк скальный. 
Ряд растений Кандалакшского заповедника занесён в Красную книгу России: кизильник киноварнокрасный, одуванчик белоязычковый, солнцецвет арктический и другие. 

Центр экологических путешествий предлагает туристический маршрут "Кандалакшский залив – остров Ряжков". Данный маршрут комбинированный: он состоит из водной и сухопутной частей. Хотя маршрут не заходит на территорию заповедника, туристы могут в полной мере насладиться красотой и удивительным многообразием природы Кандалакшского заповедника.